1994年9月，由昆明市污水处理厂筹建处、昆明市第一污水处理厂、昆明市市政设施收费管理处合并成立昆明市城市排水公司，负责昆明主城污水处理厂及配套排水管网的建设及维护运行。
2004年10月，市政府在昆明市城市排水公司基础上成立bat365在线官网登录投资有限责任公司。
2005年6月，经市国资委批准，bat365在线官网登录投资有限责任公司将昆明市城市排水公司重组为昆明排水设施管理有限责任公司(下称昆明排水公司)。
2014年11月，市政府改革排水管理体制，建立“一城一头一网”排水管理模式，将昆明市主城区公共排水设施运营维护特许经营权授予昆明排水公司。
2016年3月，市委、市政府将昆明排水公司升格为市属二类企业，定位为公益性、功能类国有企业。
昆明排水公司主要承担昆明市主城区市政公共排水设施运营维护及相关工程项目建设管理，城市防汛排涝，负责各类业务相关专业设备的管理维护经营和各类城市排水技术的研发运用推广，参与滇池保护治理等工作，是滇投公司集团化发展的一个重要实体业务板块，是昆明市市政共排水设施运营维护实施主体和城市排水技术服务平台，是滇池治理、主城截污、污水收集、调度运行主体，是昆明主城防汛排涝的主力军。
昆明排水公司依托公共排水设施特许经营权，紧紧围绕滇池治理、城市公共排水服务大局，充分运用现代技术和管理手段，着力夯实城市排水技术服务平台，全面提升城市公共排水设施健康度、维护管理运行调度水平和防汛排涝应急能力，不断巩固和发展公司在滇池治理、管网维护、污水收集调度中的基础地位，切实发挥公司在滇池水环境治理与保护中的保障作用，积极探索市场化运营模式，努力拓展业务领域范围，力争发展成为国内一流、拥有技术和管理核心竞争力的城市排水公共管理服务商和技术服务平台。
